啟明創(chuàng)投投資企業(yè)M20 Genomics在全球范圍內(nèi)正式發(fā)布首個基于隨機引物的全樣本高通量單細胞全長測序技術“M20 Seq”，這項新技術的問世標志著單細胞測序技術進入一個嶄新的時代——從科研走向臨床應用的2.0時代。
基于M20 Seq技術，M20 Genomics同步發(fā)布其首個全樣本高通量單細胞測序產(chǎn)品VITA系列（下稱“VITA”）。VITA突破性地實現(xiàn)了全樣本類型、全物種、全長RNA的（超）高通量單細胞轉(zhuǎn)錄組測序，不僅大幅度地提升了單細胞測序技術的檢測靈敏度，同時將極大地拓寬單細胞技術的應用領域。
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單細胞測序技術的現(xiàn)狀
長期以來，研究人員通過轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-Seq）來檢測組織或細胞群樣本中的RNA，在分析樣品的基因表達等情況時，單個細胞與細胞之間的差異有可能被群體的平均值所掩蓋。為解決這一困擾，單細胞測序技術應運而生。
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）技術可以在單個細胞的水平上對細胞的基因表達等信息進行檢測，它的出現(xiàn)帶來了人們對于傳統(tǒng)細胞認知體系的革命性變化。該技術已被廣泛用于包括細胞圖譜的繪制等基礎科研和疾病的早期診斷、追蹤及個體化治療等臨床研究，在腫瘤學、免疫學和神經(jīng)科學等生物醫(yī)學領域顯示出了巨大潛力。
目前市場上幾乎所有的高通量單細胞測序平臺對待測樣本的細胞活性要求都很高，一般需要70%以上的活性才能得到有意義的數(shù)據(jù)。然而，實際上，臨床的大部分樣本為凍存或福爾馬林固定、石蠟包埋（FFPE）處理的組織，細胞活性極低，很難利用目前的單細胞測序技術進行有效檢測。同時，這些技術大多基于PolyA進行RNA捕獲，只能得到細胞中RNA 3'端的信息，而不能獲得全長信息。
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M20 Seq引領單細胞技術2.0時代
2015年，美國10X Genomics公司推出全球首款基于微流控平臺的商業(yè)化單細胞測序技術，人類對生命科學的研究進入了單細胞時代。M20 Genomics團隊從技術源頭獨辟蹊徑，革命性地推出全球首個基于隨機引物的全樣本高通量單細胞全長測序技術——M20 Seq。
與現(xiàn)有的其他單細胞測序技術相比，M20 Seq具有以下優(yōu)勢特點：
1. 全長轉(zhuǎn)錄組測序。單細胞全長RNA測序可實現(xiàn)基因突變、基因融合、拷貝數(shù)變異、非編碼RNA、可變剪接等研究。
2. 全樣本類型。不僅可用于新鮮組織、凍存組織，還可以完美解決FFPE樣本難以進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的難題，使研究不再受限于樣本類型、時間、地域，更適合實驗室中心化檢測模式。
3. 高靈敏度。M20 Seq大幅度提高了單細胞測序的基因檢出數(shù)。以新鮮組織和FFPE樣本為例，單個細胞的中位基因檢出數(shù)分別可達到5000和2500，同時該方法還展現(xiàn)出了非常大的可優(yōu)化潛力。
4. 跨平臺兼容性。在液滴與微孔技術平臺均能獲得優(yōu)異的檢測效果。
5. 全物種。無論是細菌等原核生物細胞，還是人類、動物、植物等真核生物細胞，都可以通過M20 Seq進行測序。
6. 超高通量。細胞捕獲數(shù)大幅提高，最高可達到百萬級，是現(xiàn)有單細胞測序技術通量的百倍以上。
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VITA單細胞全長轉(zhuǎn)錄組測序平臺
基于M20 Seq方法的VITA平臺可以實現(xiàn)全樣本類型、全物種、全長單細胞轉(zhuǎn)錄組研究，將極大拓寬單細胞技術的應用領域。
M20 Genomics此次推出的VITA系列產(chǎn)品包含：VITAPilote系列試劑盒、VITACruiser單細胞制備儀和VITASeer軟件及數(shù)據(jù)平臺。
VITA系列產(chǎn)品全景圖
在VITA平臺上，M20 Genomics實現(xiàn)了對FFPE樣本、凍存組織及新鮮組織的檢測，實測數(shù)據(jù)表現(xiàn)出優(yōu)異性能：
不同樣本類型的基因檢出數(shù)
對FFPE樣本、凍存組織、新鮮組織、細菌樣本分別進行實驗，小提琴圖顯示各類型樣本在VITA平臺上均能達到較高的基因檢出數(shù)。
凍存樣本聚類分析
對凍存肝組織樣本進行VITA單細胞全長轉(zhuǎn)錄組測序，可以將其分為13個亞群。
雙胞率
將人類細胞與小鼠細胞進行混合實驗，雙胞率低于2%。
技術重復性測試
對小鼠新鮮腎臟組織的同一樣本進行技術性重復實驗，聚類分析顯示VITA具有優(yōu)秀的可重復性及穩(wěn)定性。
mRNA 5'-3'全長覆蓋度
VITA突破性地實現(xiàn)單細胞轉(zhuǎn)錄本全長序列測序，從5'至3'基因覆蓋度均一。
FFPE樣本的基因檢出增長曲線
VITA基于隨機引物的技術方案，隨著測序量的增加，基因檢出數(shù)相應增加，在500K reads/cell的測序深度下，未出現(xiàn)明顯平臺期。
M20 Genomics發(fā)布的革命性單細胞測序技術M20 Seq及其產(chǎn)品VITA，打破了單細胞測序的核心技術長期被國外壟斷的現(xiàn)狀，突破了單細胞技術在應用領域受到的限制，使中國企業(yè)在該領域?qū)崿F(xiàn)了技術的全球領先。其不僅降低了單細胞測序技術的使用成本，更可以讓科研和臨床人員對醫(yī)學樣本庫中的凍存、FFPE樣本開展測序工作，推動單細胞技術在腫瘤、生殖、衰老和免疫等領域的應用。
未來，M20 Genomics將充分發(fā)揮其領先的技術優(yōu)勢，面向臨床應用及藥物開發(fā)等方向持續(xù)實現(xiàn)技術突破，致力于以新一代單細胞技術引領生命科技的發(fā)展。
